MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021081	ATG	2	6	76007	76012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881714
1502	NC_021081	CCA	2	6	76119	76124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881715
1503	NC_021081	CGCTG	2	10	76141	76150	0 %	20 %	40 %	40 %	482881715
1504	NC_021081	CAC	2	6	76174	76179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881715
1505	NC_021081	GAT	2	6	76249	76254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881715
1506	NC_021081	CAC	2	6	76342	76347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881715
1507	NC_021081	CG	3	6	76370	76375	0 %	0 %	50 %	50 %	482881715
1508	NC_021081	CG	3	6	76389	76394	0 %	0 %	50 %	50 %	482881715
1509	NC_021081	GCA	3	9	76470	76478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881715
1510	NC_021081	CGG	2	6	76524	76529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881715
1511	NC_021081	G	6	6	76528	76533	0 %	0 %	100 %	0 %	482881715
1512	NC_021081	CAGC	2	8	76534	76541	25 %	0 %	25 %	50 %	482881715
1513	NC_021081	AGC	2	6	76568	76573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881715
1514	NC_021081	AGAA	2	8	76580	76587	75 %	0 %	25 %	0 %	482881715
1515	NC_021081	AAT	2	6	76629	76634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881715
1516	NC_021081	GCC	2	6	76658	76663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881715
1517	NC_021081	CGGCA	2	10	76675	76684	20 %	0 %	40 %	40 %	482881715
1518	NC_021081	CAG	2	6	76687	76692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881715
1519	NC_021081	GCT	2	6	76780	76785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881715
1520	NC_021081	GGC	2	6	76860	76865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881715
1521	NC_021081	CCA	2	6	76908	76913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881715
1522	NC_021081	AAG	2	6	76952	76957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881715
1523	NC_021081	TGA	2	6	76959	76964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881715
1524	NC_021081	CAG	2	6	76975	76980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881715
1525	NC_021081	GGC	2	6	76990	76995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881715
1526	NC_021081	GCG	2	6	77367	77372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881716
1527	NC_021081	GGT	2	6	77384	77389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881716
1528	NC_021081	TCCG	2	8	77416	77423	0 %	25 %	25 %	50 %	482881716
1529	NC_021081	TGG	2	6	77440	77445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881716
1530	NC_021081	TGCCAG	2	12	77487	77498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482881716
1531	NC_021081	GAT	2	6	77514	77519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881716
1532	NC_021081	TG	3	6	77530	77535	0 %	50 %	50 %	0 %	482881716
1533	NC_021081	CCT	2	6	77619	77624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881717
1534	NC_021081	GCG	2	6	77653	77658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881717
1535	NC_021081	TGG	2	6	77702	77707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881717
1536	NC_021081	CAT	2	6	77719	77724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881717
1537	NC_021081	CTT	2	6	77725	77730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881717
1538	NC_021081	CGA	2	6	77745	77750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881717
1539	NC_021081	GCG	2	6	77792	77797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881717
1540	NC_021081	AGC	2	6	77857	77862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881717
1541	NC_021081	GCT	2	6	77870	77875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881717
1542	NC_021081	CCAC	2	8	77949	77956	25 %	0 %	0 %	75 %	482881717
1543	NC_021081	CAT	2	6	77976	77981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881717
1544	NC_021081	GCA	2	6	78025	78030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881717
1545	NC_021081	ACC	2	6	78058	78063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881717
1546	NC_021081	GCC	2	6	78070	78075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881717
1547	NC_021081	TGCC	2	8	78087	78094	0 %	25 %	25 %	50 %	482881717
1548	NC_021081	CAT	2	6	78108	78113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881717
1549	NC_021081	GGT	2	6	78147	78152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881717
1550	NC_021081	CGGAG	2	10	78177	78186	20 %	0 %	60 %	20 %	482881717
1551	NC_021081	GGC	3	9	78324	78332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881717
1552	NC_021081	ACC	2	6	78355	78360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881717
1553	NC_021081	CTA	2	6	78390	78395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881717
1554	NC_021081	ACCCCT	2	12	78632	78643	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	482881718
1555	NC_021081	GCT	2	6	78715	78720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881718
1556	NC_021081	GCCA	2	8	78729	78736	25 %	0 %	25 %	50 %	482881718
1557	NC_021081	C	6	6	78763	78768	0 %	0 %	0 %	100 %	482881718
1558	NC_021081	GCT	2	6	78810	78815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881718
1559	NC_021081	GAT	2	6	78867	78872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881718
1560	NC_021081	CAC	3	9	78873	78881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881718
1561	NC_021081	ATC	2	6	78961	78966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881718
1562	NC_021081	TCG	2	6	78967	78972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881718
1563	NC_021081	GTA	2	6	78984	78989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881718
1564	NC_021081	GTG	2	6	79006	79011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881718
1565	NC_021081	GCC	2	6	79059	79064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881718
1566	NC_021081	CAG	2	6	79206	79211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881718
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1569	NC_021081	TGC	2	6	79328	79333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881718
1570	NC_021081	GCA	2	6	79388	79393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881718
1571	NC_021081	ATC	2	6	79444	79449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881718
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1575	NC_021081	CAG	2	6	79694	79699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881719
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1579	NC_021081	TCG	2	6	79878	79883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881719
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1588	NC_021081	A	6	6	80300	80305	100 %	0 %	0 %	0 %	482881719
1589	NC_021081	GAA	2	6	80312	80317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881719
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1596	NC_021081	GAAAAG	2	12	80676	80687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881719
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1623	NC_021081	ATGT	2	8	81959	81966	25 %	50 %	25 %	0 %	482881720
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1998	NC_021081	G	7	7	101190	101196	0 %	0 %	100 %	0 %	482881746
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